声明:本专栏主要对生命科学领域的一些期刊文章标题进行翻译,所有内容均由本人手工整理翻译。由于本人专业为生物分析相关,其他领域如果出现翻译错误请谅解。
1.Method of the Year 2022: Long-read sequencing. Long-read sequencing is our pick for the Method of the Year 2022, owing to its unparalleled utility in reading genomes, transcriptomes and epigenomes with high accuracy and completeness.
2022 年度方法:长读测序。长读测序被我们选为 2022 年度方法,因为它在读取基因组、转录组和表观基因组方面具有无与伦比的实用性,且具有高精度和完整性。
2.Digital brain atlases reveal postnatal development to 2 years of age in human infants.
数字大脑图谱揭示了人类婴儿出生后至 2 岁的发育情况。
3.Deep-learning language models help to improve protein sequence alignment.
深度学习语言模型有助于改善蛋白质序列比对。
4.Fast cryo-electron tomography data acquisition to determine molecular structures in situ.
快速冷冻电子断层扫描数据采集,可原位确定分子结构。
5.LocMoFit quantifies cellular structures in super-resolution data.
LocMoFit 可量化超分辨率数据中的细胞结构。
6.3D vascularized eye tissue models age-related macular degeneration.
3D 血管化眼组织模型与年龄相关的黄斑变性。
7.Multiplexed transcriptome discovery of RNA-binding protein binding sites by antibody-barcode eCLIP.
通过抗体条形码 eCLIP 发现 RNA 结合蛋白结合位点的多重转录组。
8.Deep-tissue SWIR imaging using rationally designed small red-shifted near-infrared fluorescent protein.
使用合理设计的小型红移近红外荧光蛋白进行深部组织短波红外成像。
9.Nano3P-seq: transcriptome-wide analysis of gene expression and tail dynamics using end-capture nanopore cDNA sequencing.
Nano3P-seq:使用末端捕获纳米孔 cDNA 测序对基因表达和尾部动力学进行全转录组分析。
10.Efficient combinatorial targeting of RNA transcripts in single cells with Cas13 RNA Perturb-seq.
使用 Cas13 RNA Perturb-seq 有效组合靶向单细胞中的 RNA 转录本。
11.Virus-assisted directed evolution of enhanced suppressor tRNAs in mammalian cells.
哺乳动物细胞中增强型抑制 tRNA 的病毒辅助定向进化。
12.Deep embedding and alignment of protein sequences.
蛋白质序列的深度嵌入和比对。
13.A general method for chemogenetic control of peptide function.
肽功能化学遗传学控制的通用方法。
14.Uniform thin ice on ultraflat graphene for high-resolution cryo-EM.
超扁平石墨烯上的均匀薄冰用于高分辨率冷冻电镜。
15.Parallel cryo electron tomography on in situ lamellae.
原位薄片上的并行冷冻电子断层扫描。
16.Maximum-likelihood model fitting for quantitative analysis of SMLM data.
用于 SMLM 数据定量分析的最大似然模型拟合。
17.Bioprinted 3D outer retina barrier uncovers RPE-dependent choroidal phenotype in advanced macular degeneration.
生物打印 3D 外视网膜屏障揭示了晚期黄斑变性中 RPE 依赖性脉络膜表型。
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1.Robust signal separation in multiplexed fluorescence microscopy. Highly multiplexed fluorescence images of embryonic zebrafish using data analyzed with the Hybrid Unmixing (HyU) method.
多重荧光显微镜中稳健的信号分离。使用混合分离 (HyU) 方法分析的数据获得胚胎斑马鱼的高度多重荧光图像。
2.A mathematical method and software for spatially mapping intercellular communication.
用于空间映射细胞间通讯的数学方法和软件。
3.Parts-based decomposition of spatial genomics data finds distinct tissue regions.
空间基因组数据的基于部分的分解可以找到不同的组织区域。
4.Artificial intelligence gives neuron reconstruction a performance boost.
人工智能使神经元重建性能得到提升。
5.Confident multimodal analysis of single cells across platforms and species.
对跨平台和物种的单细胞进行可靠的多模式分析。
6.Guiding the choice of informatics software and tools for lipidomics research applications.
指导脂质组学研究应用信息学软件和工具的选择。
7.LILAC: enhanced actin imaging with an optogenetic Lifeact.
LILAC:利用光遗传学 Lifeact 增强肌动蛋白成像。
8.Screening cell–cell communication in spatial transcriptomics via collective optimal transport.
通过集体最佳运输筛选空间转录组学中的细胞间通讯。
9.Nonnegative spatial factorization applied to spatial genomics.
非负空间分解应用于空间基因组学。
10.Haplotype-aware pantranscriptome analyses using spliced pangenome graphs.
使用剪接的泛基因组图进行单倍型感知的泛转录组分析。
11.HyU: Hybrid Unmixing for longitudinal in vivo imaging of low signal-to-noise fluorescence.
HyU:用于低信噪比荧光纵向体内成像的混合分离。
12.A framework for evaluating the performance of SMLM cluster analysis algorithms.
用于评估 SMLM 聚类分析算法性能的框架。
13.Integrated multimodality microscope for accurate and efficient target-guided cryo-lamellae preparation.
集成多模态显微镜可实现准确、高效的目标引导冷冻片层制备。
14.ELI trifocal microscope: a precise system to prepare target cryo-lamellae for in situ cryo-ET study.
ELI 三焦点显微镜:为原位冷冻电子发射研究制备目标冷冻片层的精确系统。
15.Convolutional networks for supervised mining of molecular patterns within cellular context.
用于监督挖掘细胞环境中分子模式的卷积网络。
16.Local shape descriptors for neuron segmentation.
用于神经元分割的局部形状描述符。
17.Robust single-cell matching and multimodal analysis using shared and distinct features.
使用共享和独特的特征进行稳健的单细胞匹配和多模态分析。
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1.Focus on single-cell proteomics. Multiple established and emerging technologies are being applied for the analysis of the single-cell proteome, as covered in this month’s Focus on single-cell proteomics.
专注于单细胞蛋白质组学。多种成熟的和新兴的技术正在应用于单细胞蛋白质组的分析,正如本月的单细胞蛋白质组学聚焦中所介绍的那样。
2.Spatial Omics DataBase (SODB): increasing accessibility to spatial omics data.
空间组学数据库 (SODB):提高空间组学数据的可访问性。
3.A deconvolution algorithm to achieve super-resolution stimulated Raman scattering imaging.
一种实现超分辨率受激拉曼散射成像的反卷积算法。
4.Initial recommendations for performing, benchmarking and reporting single-cell proteomics experiments.
关于执行、基准测试和报告单细胞蛋白质组学实验的初步建议。
5.EnzymeML: seamless data flow and modeling of enzymatic data.
EnzymeML:无缝数据流和酶数据建模。
6.A modular architecture for organizing, processing and sharing neurophysiology data.
用于组织、处理和共享神经生理学数据的模块化架构。
7.Jasmine and Iris: population-scale structural variant comparison and analysis.
茉莉花和鸢尾花:群体规模结构变异比较和分析。
8.Optimizing multiplexed imaging experimental design through tissue spatial segregation estimation.
通过组织空间分离估计优化多重成像实验设计。
9.In silico tissue generation and power analysis for spatial omics.
空间组学的计算机组织生成和功率分析。
10.Engineering of bidirectional, cyanobacteriochrome-based light-inducible dimers (BICYCL)s.
基于蓝藻色素的双向光诱导二聚体 (BICYCL) 的工程。
11.Self-supervised machine learning pushes the sensitivity limit in label-free detection of single proteins below 10 kDa.
自监督机器学习突破了 10 kDa 以下单一蛋白质无标记检测的灵敏度极限。
12.Super-resolution SRS microscopy with A-PoD.
采用 A-PoD 的超分辨率 SRS 显微镜。
13.Field-dependent deep learning enables high-throughput whole-cell 3D super-resolution imaging.
场相关深度学习可实现高通量全细胞 3D 超分辨率成像。
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1.Miniscopes for imaging in mice and juvenile zebra finches. Miniature head-mounted microscopes provide expansive views of neurons in songbird and mouse brains.
用于小鼠和幼年斑胸草雀成像的微型显微镜。微型头戴式显微镜提供了鸣禽和小鼠大脑中神经元的广阔视野。
2.A brilliant monomeric red fluorescent protein combining high brightness and fast maturation.
一种明亮的单体红色荧光蛋白,结合了高亮度和快速成熟。
3.Outbreak.info Research Library: a standardized, searchable platform to discover and explore COVID-19 resources.
Outbreak.info 研究图书馆:一个标准化、可搜索的平台,用于发现和探索 COVID-19 资源。
4.mScarlet3: a brilliant and fast-maturing red fluorescent protein.
mScarlet3:一种明亮且快速成熟的红色荧光蛋白。
5.An optical design enabling lightweight and large field-of-view head-mounted microscopes.
光学设计可实现轻量化和大视场的头戴式显微镜。
6.SVDSS: structural variation discovery in hard-to-call genomic regions using sample-specific strings from accurate long reads.
SVDSS:使用来自准确长读的样本特定字符串在难以调用的基因组区域中发现结构变异。
7.Cue: a deep-learning framework for structural variant discovery and genotyping.
Cue:用于结构变异发现和基因分型的深度学习框架。
8.ERnet: a tool for the semantic segmentation and quantitative analysis of endoplasmic reticulum topology.
ERnet:内质网拓扑语义分割和定量分析的工具。
9.Combining long-term circuit mapping and network transcriptomics with SiR-N2c.
将长期电路图谱和网络转录组学与 SiR-N2c 相结合。
10.Femtosecond laser microdissection for isolation of regenerating C. elegans neurons for single-cell RNA sequencing.
飞秒激光显微切割用于分离再生秀丽隐杆线虫神经元以进行单细胞 RNA 测序。
11.Mesoscale volumetric light-field (MesoLF) imaging of neuroactivity across cortical areas at 18 Hz.
18 Hz 下皮层区域神经活动的中尺度体积光场 (MesoLF) 成像。
12.A three-photon head-mounted microscope for imaging all layers of visual cortex in freely moving mice.
一种三光子头戴式显微镜,用于对自由移动的小鼠的所有视觉皮层层进行成像。
13.Miniature three-photon microscopy maximized for scattered fluorescence collection.
微型三光子显微镜最大限度地收集散射荧光。
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1.Temporal profiling of the secretome. Capture of secreted proteins onto their source cell surfaces using an affinity matrix enables simultaneous measurement of protein secretion, cell surface proteins and transcriptomes in thousands of cells at single-cell resolution.
分泌蛋白组的时间分析。使用亲和基质将分泌蛋白捕获到其源细胞表面上,能够以单细胞分辨率同时测量数千个细胞中的蛋白分泌、细胞表面蛋白和转录组。
2.Deep-brain photoactivation of an opioid peptide shapes mouse behavior within seconds.
阿片肽的深部脑光激活可在几秒钟内塑造小鼠的行为。
3.Photoselective sequencing harnesses microscopy to guide genomic analyses.
光选择性测序利用显微镜来指导基因组分析。
4.Extending the sensitivity, consistency and depth of single-cell proteomics.
扩展单细胞蛋白质组学的灵敏度、一致性和深度。
5.Single-cell measurement of dynamic protein secretion and transcriptome.
动态蛋白质分泌和转录组的单细胞测量。
6.Photon-based communication between two neurons in Caenorhabditis elegans.
秀丽隐杆线虫两个神经元之间基于光子的通信。
7.Julia for biologists.
生物学家的朱莉娅。
8.CD-CODE: crowdsourcing condensate database and encyclopedia.
CD-CODE:众包凝数据库和百科全书。
9.Rapid biomechanical imaging at low irradiation level via dual line-scanning Brillouin microscopy.
通过双线扫描布里渊显微镜在低辐射水平下进行快速生物力学成像。
10.In vivo photopharmacology with a caged mu opioid receptor agonist drives rapid changes in behavior.
笼式 mu 阿片受体激动剂的体内光药理学可驱动行为的快速变化。
11.Photoselective sequencing: microscopically guided genomic measurements with subcellular resolution.
光选择性测序:具有亚细胞分辨率的显微镜引导基因组测量。
12.Spatiotemporally resolved transcriptomics reveals the subcellular RNA kinetic landscape.
时空解析转录组学揭示了亚细胞 RNA 动力学景观。
13.Improving the sensitivity of in vivo CRISPR off-target detection with DISCOVER-Seq+.
使用 DISCOVER-Seq+ 提高体内 CRISPR 脱靶检测的灵敏度。
14.Prioritized mass spectrometry increases the depth, sensitivity and data completeness of single-cell proteomics.
优先质谱分析提高了单细胞蛋白质组学的深度、灵敏度和数据完整性。
15.Time-resolved assessment of single-cell protein secretion by sequencing.
通过测序对单细胞蛋白质分泌进行时间分辨评估。
16.Virtual-scanning light-field microscopy for robust snapshot high-resolution volumetric imaging.
虚拟扫描光场显微镜可实现强大的快照高分辨率体积成像。
17.Rapid detection of neurons in widefield calcium imaging datasets after training with synthetic data.
使用合成数据训练后,快速检测宽场钙成像数据集中的神经元。
18.High-resolution line-scan Brillouin microscopy for live imaging of mechanical properties during embryo development.
高分辨率线扫描布里渊显微镜,用于胚胎发育过程中机械特性的实时成像。
19.Neural engineering with photons as synaptic transmitters.
以光子作为突触递质的神经工程。
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1.Native mass spectrometry reveals membrane protein–lipid complexes. A native mass spectrometry platform captures membrane protein–lipid organization directly from tunable lipid membranes and affords molecular understanding of how specific membrane lipids and biophysical properties regulate these assemblies.
天然质谱揭示了膜蛋白-脂质复合物。天然质谱平台直接从可调谐脂质膜捕获膜蛋白-脂质组织,并提供对特定膜脂质和生物物理特性如何调节这些组件的分子理解。
2.AI identifies developmental defects and drug mechanisms in embryos.
人工智能可以识别胚胎中的发育缺陷和药物机制。
3.Highly efficient and rapid generation of genetic variants.
高效、快速地产生遗传变异。
4.Mapping the motion and structure of flexible proteins from cryo-EM data.
根据冷冻电镜数据绘制柔性蛋白质的运动和结构图。
5.Accurate determination of molecular formulae using tandem mass spectrometry.
使用串联质谱法准确测定分子式。
6.Capturing prime editor off-target sites within the genome.
捕获基因组内的 Prime Editor 脱靶位点。
7.Machine learning in rare disease.
罕见疾病中的机器学习。
8.High-contrast en bloc staining of mouse whole-brain and human brain samples for EM-based connectomics.
对小鼠全脑和人脑样本进行高对比度整体染色,用于基于 EM 的连接组学。
9.Fast and efficient template-mediated synthesis of genetic variants.
快速有效的模板介导的遗传变异的合成。
10.Nano-DMS-MaP allows isoform-specific RNA structure determination.
Nano-DMS-MaP 允许确定异构体特异性 RNA 结构。
11.3DFlex: determining structure and motion of flexible proteins from cryo-EM.
3DFlex:通过冷冻电镜确定柔性蛋白质的结构和运动。
12.TomoTwin: generalized 3D localization of macromolecules in cryo-electron tomograms with structural data mining.
TomoTwin:通过结构数据挖掘对冷冻电子断层图中大分子进行广义 3D 定位。
13.BUDDY: molecular formula discovery via bottom-up MS/MS interrogation.
BUDDY:通过自下而上的 MS/MS 询问发现分子式。
14.Direct determination of oligomeric organization of integral membrane proteins and lipids from intact customizable bilayer.
直接测定完整的可定制双层的整合膜蛋白和脂质的寡聚组织。
15.Genome-wide profiling of prime editor off-target sites in vitro and in vivo using PE-tag.
使用 PE 标签对体外和体内 Prime 编辑器脱靶位点进行全基因组分析。
16.Engineered allostery in light-regulated LOV-Turbo enables precise spatiotemporal control of proximity labeling in living cells.
光调节 LOV-Turbo 中的工程变构能够对活细胞中的邻近标记进行精确的时空控制。
17.Engineering of NEMO as calcium indicators with large dynamics and high sensitivity.
NEMO工程化作为钙指示剂,具有大动态和高灵敏度。
18.Glutamate indicators with improved activation kinetics and localization for imaging synaptic transmission.
谷氨酸指示剂具有改进的激活动力学和定位,用于成像突触传递。
19.Cross-modality supervised image restoration enables nanoscale tracking of synaptic plasticity in living mice.
跨模态监督图像恢复能够对活体小鼠的突触可塑性进行纳米级跟踪。
到此这篇ptl审稿周期(tpel审稿周期)的文章就介绍到这了,更多相关内容请继续浏览下面的相关推荐文章,希望大家都能在编程的领域有一番成就!
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