生物学习路的开始阶段,需要了解记录基因的相关文件,文件不了解,基因分析完全做不了,开始学习基因文件。
基因文件形式主要分类两大类:
- ped + map
- bed + bim + fam
第一组:
在第一组文件中,做基因分析主要用ped文件即可,其中包含了每个个体、个体亲本、表现型、基因型在内的所有信息,map包含了ped中基因型的所有位置信息,该组数据方便人的阅读,但是在机器分析中运算速度低,不便于计算机使用。
ped(pedigree)文件
AC
Family IDIndividual IDPaternal IDMaternal IDSexPhenotypeGenotypes......家族ID个人ID父亲ID母亲ID性别表型基因型map文件
第二组:
该组文件主要是用于数据处理,bed文件是最大的文件,包含了最全的信息,计算机处理该文件速度较快,常用该组数据对基因数据进行分析。
bed文件:二进制文件,打开看不懂。
bim文件:
fam(family)文件:包括了家庭信息文件
文件转换:
到此这篇ped文件怎么打开(ped格式的文件怎么打开)的文章就介绍到这了,更多相关内容请继续浏览下面的相关推荐文章,希望大家都能在编程的领域有一番成就!版权声明:
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